আরাফাত রহমান

ঢাকা বিশ্ববিদ্যালয় থেকে অণুজীববিজ্ঞান বিভাগে স্নাতক ও স্নাতকোত্তর শেষ করে ইউনিভার্সিটি অব ক্যালিফোর্নিয়া থেকে জেনেটিক্স, জিনোমিক্স ও বায়োইনফরমেটিক্স বিষয়ে পিএইচডি সম্পন্ন করেছি।বর্তমানে ওরেগন স্টেট ইউনিভার্সিটিতে পোস্ট-ডক্টোরাল গবেষক হিসেবে কার্যরত আছি।আমার প্রকাশিত বই “জেনেটিক্স: বংশগতিবিদ্যার সহজপাঠ” (UPL/প্রকৃতি পরিচয়, ২০২২), “মস্তিষ্ক, ঘুম ও স্বপ্ন” (প্রকৃতি পরিচয়, ২০১৫) ও “প্রাণের বিজ্ঞান” (প্রকৃতি পরিচয়, ২০১৭)।

সুকেন্দ্রিকদের উদ্ভব কেন অসম্ভব-সম্ভাবনা ছিলো?
[একমেবাদ্বিতীয়ম্ সংযোজন – ২য় কিস্তি] সুকেন্দ্রীক-কোষের কিছু অংশ এক সময় অন্তঃমিথোজীবী স্বাধীন অণুজীব হিসেবে ছিলো যারা পরবর্তীতে অন্য কোষের মধ্যে স্থায়ী ঠিকানা গড়ে নেয় – রাশিয়ান বিজ্ঞানী কনস্ট্যানটিন মেরেস্কোস্কি ১৯০৫ সালে সর্বপ্রথম এ ধারণা দেন। তিনি ভেবেছিলেন নিউক্লিয়াস এভাবে গড়ে উঠেছে, আর সৌরালোক থেকে উদ্ভিদকোষকে শক্তি জোগানো ক্লোরোপ্লাস্টের উদ্ভবও একইভাবে। অন্তঃমিথোজীবির তালিকায় প্রথমে মাইটোকন্ড্রিয়া বাদ…
প্রাণের প্রথম একশ কোটি বছর কেন একঘেয়ে ছিলো?
[একমেবাদ্বিতীয়ম্ সংযোজন – ১ম কিস্তি] প্রথম দেখায় একটি গাছ থেকে ঐ গাছের পাতা খাওয়া শুঁয়োপোকা, গাছের বাকল থেকে অঙ্কুরিত ব্যাঙের ছাতা, গুঁড়ির পাশে বর্ধনশীল ঘাস, কিংবা তরু ছায়ায় বসে গল্প করা যুগল – কোন কিছুই দেখতে এক রকম লাগবে না। তবে বাহ্যরূপ ছলনাপূর্ণ হতে পারে। আণুবীক্ষণিক পর্যায়ে বিবর্ধিত করে দেখা হলে এদের কাঠামোগত সাদৃশ্য অবাক…
রোজেটা স্টোন (গেম অব জিনোমস)
[আগের অধ্যায় | সূচীপত্র | পরের অধ্যায়] খন্ড-১, অধ্যায়-৪ ম্যাসাচুসেটেসের কেমব্রিজ শহর। ব্রড ইনস্টিটিউটের একটি প্রশস্ত জানালা দিয়ে রোদ চুঁইয়ে পড়ছিলো, আর বিপরীত দেয়ালে হোয়াইটবোর্ডে এলোমেলো লেখা সে রোদেলা আলোয় আলোকিত হয়েছিলো। কনরাড কার্কেজোস্কি, একজন তরুণ বায়োইনফরমেটিক্স বিশেষজ্ঞ, প্রায় ঘন্টাখানেক ধরে সে হোয়াইটবোর্ডে বোঝাচ্ছিলেন আমার জিনোম উপাত্তের বিস্তারিত, যা এখন তার ল্যাপটপের স্ক্রিনে ভেসে উঠেছে।…
BAM উন্মোচন (গেম অব জিনোমস)
[আগের অধ্যায় | সূচীপত্র | পরের অধ্যায়] খন্ড-১, অধ্যায়-৩ আমি জানলাম, জিনোম সিকোয়েন্সিং করার পর প্রাথমিক উপাত্ত যাচাই বাছাই করে যে ফাইল তৈরি করা হয় তা হলো BAM। এই ফাইলগুলো আকারে দৈত্যাকার — ৭০ গিগাবাইটের মতো, যার মাঝে অন্তত চারশতাধিক পূর্ণদৈর্ঘ্যের চলচিত্র আঁটবে। যতবড়ই হোক না কেন আকারে, অন্য কোন ফাইল দিয়ে বিজ্ঞানীরা জিনোমকে তার…
সংকেত ভাঙার পর (গেম অব জিনোমস)
[আগের অধ্যায় | সূচীপত্র | পরের অধ্যায়] খন্ড-১, অধ্যায়-২ নিজের জিনোম সিকোয়েন্স করবো। এ সিদ্ধান্ত নেয়ার কিছুদিন পর আমি বোস্টনের এক হাসপাতালে আবিষ্কার করি। একজন বংশগতি-বিশেষজ্ঞ আমার মুখে আকুপাকু করে কিছু খুঁজছিলেন। ড. রবার্ট গ্রিন বললেন, “আমি আসলে তোমার চেহারায় কোন বিশেষ বৈশিষ্ট্য আছে কি না সেটা খুঁজছি, যা থেকে তোমার বংশগতির রোগ থাকলে তার…
হার্ডড্রাইভের মধ্যে মানুষটি (গেম অব জিনোমস)
[বিজ্ঞান লেখক কার্ল জিমার নিজের জিনোম সিকোয়েন্সিং করেছিলেন। শুধু তাই না, বিভিন্ন বিজ্ঞানীর সাথে মিলে নিজের জিনোমের ব্যবচ্ছেদও করেছিলেন। বায়োইনফরমেটিক্স, জেনোমিক্স, সিকোয়েন্স এনালাইসিসের প্রতিটি ধাপে খুঁটিয়ে বুঝেছিলেন। এই অভিজ্ঞতা নিয়ে তার একটা বিশাল ধারাবাহিক আছে, Game of Genomes। প্রায় দুই বছর আগে লস এঞ্জেলসে একটা বিজ্ঞান বক্তৃতায় কার্ল জিমারের সাথে আমার দেখা হয়। এই সিরিজটা…
এইচআইভি ভাইরাস উদ্ভবের আশ্চর্য ইতিহাস
২০২০ বসন্ত-কোয়ার্টারে UCR-এ TA করার সময় শিক্ষার্থীদের বিবর্তন কোর্সে Sharp and Hahn (2011) পেপারটা ডিসকাশন সেকশনে আলোচনা করেছিলাম। তখনো নভেল করোনা ভাইরাস নতুন ছিলো। কিন্তু নভেল করোনা ভাইরাস যেভাবে অতিমারী (pandemic) তৈরি করে সারা বিশ্বে ছড়িয়ে গেছে, সেটা নতুন ছিলো না। প্রায় একশ বছর আগেই এইচআইভি ভাইরাস প্রায় একই প্রক্রিয়ায় সারা পৃথিবীতে ছড়িয়ে গেছে। এই…
পুরাবংশগতিবিদ্যা আমাদের আদি-পূর্বপুরুষ সম্পর্কে কি বলতে পারে
মানব ইতিহাসের অধিকাংশই প্রাগৈতিহাসিক। পৃথিবীর বুকে মানুষ যে দুই লক্ষাধিক বছর সময় অতিবাহিত করেছে তার অতি ক্ষুদ্রাংশই লেখনীর মাধ্যমে নথিবদ্ধ হয়েছে। চলমান ভূতাত্ত্বিক যুগ হলোসিনের বারো হাজার বছরের অল্প সময়টুকুতে উষ্ণ আবহাওয়া ও মোটামুটি স্থিতিশীল জলবায়ু কৃষি, শহর, রাষ্ট্র ও সভ্যতার অন্যান্য নির্দেশকের জন্ম দিয়েছে। সে সময়কালের মধ্যেও লেখালেখি নিয়মের ব্যতিক্রম হিসেবেই রয়ে গেছে। পেশাদার…
‘বংশে’-র গল্প কিভাবে ‘গতি’ পেল
১৯৯৯ সালে বাংলাদেশের ঝিনাইদহ জেলায় কৃষক হরিপদ কাপালি নিজ ধানের ক্ষেতে চাষাবাদের সময় একটি অনন্য পর্যবেক্ষণ করেন। ধানগাছের একটি ছড়া তার নজর কাড়ে, যার গোছা পুষ্ট, ছড়া গুলো দীর্ঘ। তিনি এ ছড়া সংগ্রহ করে পাকা ধান বীজ হিসেবে রেখে দেন। পরের মৌসুমে চাষ করে এই বীজ থেকে তিনি আশাতীত ফলন পেলেন। এ থেকে পৃথিবীতে নতুন…